一、全市各县(市、区)共有10个职能局,内设机构分两类设置:
(一)麒麟区、宣威市、会泽县、陆良县国家税务局设10个内设机构,分别是:办公室、政策法规科、货物和劳务税科、所得税科、收入核算科、纳税服务科、征收管理科、人事教育科、监察室、办税服务厅,级别为正股级。
(二)沾益县、富源县、马龙县、师宗县、罗平县、曲靖经济技术开发区国家税务局设8个内设机构,分别是:办公室、政策法规科、税政科、收入核算科、征收管理科、人事教育科、监察室、办税服务厅,级别为正股级。
二、各县(市、区)国家税务局均设置直属机构1个,即稽查局,级别为副科级。
三、各县(市、区)国家税务局均设置事业单位1个,即信息中心,级别为正股级。
四、派出机构
全市国税系统10个县(市、区)局共设22个税务分局,级别为副科级。麒麟区国家税务局麒麟税务分局、越州税务分局,沾益县国家税务局西平税务分局、花山税务分局,富源县国家税务局中安税务分局、营上税务分局、黄泥河税务分局,宣威市国家税务局榕城税务分局、开发区税务分局、格宜税务分局、羊场税务分局、倘塘税务分局,会泽县国家税务局金钟税务分局、者海税务分局,马龙县国家税务局第一税务分局、第二税务分局,陆良县国家税务局第一税务分局、第二税务分局,师宗县国家税务局丹凤税务分局,罗平县国家税务局第一税务分局、第二税务分局,曲靖经济技术开发区国家税务局城区税务分局。