缴纳环境保护税。砂石未覆盖导致粉尘污染,需要按照《中华人民共和国环境保护税法》的规定,可以依法申报缴纳环境保护税。根据该法规定,在施工作业过程向外界环境排放的粉尘污染,应当按照规定缴纳环境保护税。因此,砂石未覆盖导致粉尘污染,应当及时申报缴纳相应的环境保护税。