不需要存抵扣联。抵扣联是企业按照税法的规定在支付了上一道环节的增值税以后,在本单位用于应纳税额抵扣的凭证。电子专票是税务机关依托于增值税发票系统,将专用发票的电子信息加密形成二维码,并通过有关服务平台推送至增值税纳税人使用的新型发票。所以电子专票不需要抵扣联。