厦门税务局长归福建税务局管。因为2018年6月，福建省税务局和厦门市税务局正式合并成立国家税务总局福建省税务局，所以厦门税务局长归福建税务局管。福建省税务局是正厅级单位，厦门市税务局也是正厅单位，局长为正厅级。由于厦门是副省级城市、计划单列市，所以厦门市税务局不同于一般的市税务局。因此，福建省税务局局长和厦门市税务局局长级别相同，均为正厅级干部。
